Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALAP11233 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALAP11233 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALAP11233 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALAP11233 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALAP11233 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALAP11233 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RALAP11233 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALAP11233 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALAP11233 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALAP11233 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALAP11233 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALAP11233 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALAP11233 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RALAP11233 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALAP11233 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALAP11233 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALAP11233 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALAP11233 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALAP11233 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALAP11233 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALAP11233 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALAP11233 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALAP11233 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RALAP11233 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RALAP11233 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RALAP11233 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RALAP11233 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RALAP11233 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RALAP11233 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RALAP11233 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RALAP11233 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RALAP11233 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RALAP11233 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALAP11233 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALAP11233 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALAP11233 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALAP11233 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALAP11233 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALAP11233 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALAP11233 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RALAP11233 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALAP11233 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RALAP11233 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALAP11233 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALAP11233 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALAP11233 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALAP11233 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALAP11233 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RALAP11233 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALAP11233 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALAP11233 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALAP11233 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALAP11233 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RALAP11233 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RALAP11233 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALAP11233 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALAP11233 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALAP11233 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALAP11233 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALAP11233 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALAP11233 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALAP11233 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALAP11233 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALAP11233 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALAP11233 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALAP11233 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALAP11233 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALAP11233 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALAP11233 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALAP11233 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RALAP11233 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALAP11233 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RALAP11233 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RALAP11233 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALAP11233 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALAP11233 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALAP11233 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALAP11233 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RALAP11233 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALAP11233 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms