Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARBP10826 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARBP10826 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARBP10826 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARBP10826 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARBP10826 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARBP10826 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARBP10826 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARBP10826 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARBP10826 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARBP10826 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARBP10826 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARBP10826 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARBP10826 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARBP10826 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARBP10826 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARBP10826 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARBP10826 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARBP10826 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARBP10826 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARBP10826 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARBP10826 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARBP10826 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARBP10826 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARBP10826 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARBP10826 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARBP10826 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARBP10826 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARBP10826 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARBP10826 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RARBP10826 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARBP10826 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARBP10826 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARBP10826 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARBP10826 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARBP10826 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RARBP10826 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARBP10826 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARBP10826 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARBP10826 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARBP10826 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARBP10826 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARBP10826 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARBP10826 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RARBP10826 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARBP10826 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARBP10826 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARBP10826 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARBP10826 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARBP10826 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARBP10826 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARBP10826 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARBP10826 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARBP10826 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARBP10826 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARBP10826 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARBP10826 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARBP10826 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARBP10826 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARBP10826 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARBP10826 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARBP10826 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARBP10826 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARBP10826 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RARBP10826 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARBP10826 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARBP10826 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARBP10826 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARBP10826 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARBP10826 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARBP10826 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARBP10826 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RARBP10826 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RARBP10826 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RARBP10826 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARBP10826 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARBP10826 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARBP10826 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARBP10826 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RARBP10826 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARBP10826 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARBP10826 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARBP10826 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARBP10826 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARBP10826 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARBP10826 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARBP10826 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARBP10826 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARBP10826 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RARBP10826 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARBP10826 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARBP10826 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARBP10826 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARBP10826 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARBP10826 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARBP10826 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARBP10826 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARBP10826 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARBP10826 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARBP10826 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms