Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP3P10745 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP3P10745 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RBP3P10745 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP3P10745 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP3P10745 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP3P10745 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP3P10745 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP3P10745 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP3P10745 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP3P10745 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP3P10745 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP3P10745 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP3P10745 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP3P10745 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP3P10745 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP3P10745 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP3P10745 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP3P10745 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP3P10745 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP3P10745 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP3P10745 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP3P10745 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP3P10745 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP3P10745 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP3P10745 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP3P10745 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP3P10745 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP3P10745 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP3P10745 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP3P10745 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP3P10745 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP3P10745 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP3P10745 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP3P10745 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP3P10745 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP3P10745 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP3P10745 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP3P10745 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP3P10745 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP3P10745 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP3P10745 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP3P10745 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP3P10745 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP3P10745 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP3P10745 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP3P10745 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP3P10745 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms