Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms