Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD2P0DJD1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD2P0DJD1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms