Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00869P0C866 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00869P0C866 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms