Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00032P0C843 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00032P0C843 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00032P0C843 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00032P0C843 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINC00032P0C843 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00032P0C843 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00032P0C843 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00032P0C843 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00032P0C843 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00032P0C843 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00032P0C843 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00032P0C843 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00032P0C843 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00032P0C843 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00032P0C843 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00032P0C843 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00032P0C843 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00032P0C843 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00032P0C843 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00032P0C843 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00032P0C843 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00032P0C843 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00032P0C843 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00032P0C843 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00032P0C843 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00032P0C843 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00032P0C843 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00032P0C843 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00032P0C843 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00032P0C843 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00032P0C843 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LINC00032P0C843 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00032P0C843 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00032P0C843 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00032P0C843 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00032P0C843 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00032P0C843 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00032P0C843 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00032P0C843 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00032P0C843 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms