Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C4AP0C0L4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4AP0C0L4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4AP0C0L4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms