Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HOXB7P09629 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms