Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PKHD1P08F94 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PKHD1P08F94 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms