Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL2A1P02458 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL2A1P02458 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL2A1P02458 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms