Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F2P00734 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F2P00734 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F2P00734 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F2P00734 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F2P00734 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F2P00734 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
F2P00734 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F2P00734 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F2P00734 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F2P00734 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F2P00734 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F2P00734 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F2P00734 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F2P00734 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F2P00734 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F2P00734 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F2P00734 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F2P00734 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F2P00734 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
F2P00734 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F2P00734 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F2P00734 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F2P00734 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F2P00734 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F2P00734 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F2P00734 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F2P00734 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F2P00734 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F2P00734 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
F2P00734 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F2P00734 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F2P00734 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F2P00734 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F2P00734 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P00734 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F2P00734 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
F2P00734 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F2P00734 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
F2P00734 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
F2P00734 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F2P00734 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F2P00734 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P00734 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P00734 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P00734 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P00734 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P00734 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P00734 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P00734 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P00734 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P00734 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P00734 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P00734 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P00734 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P00734 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F2P00734 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
F2P00734 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F2P00734 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
F2P00734 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
F2P00734 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F2P00734 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F2P00734 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F2P00734 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F2P00734 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F2P00734 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F2P00734 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F2P00734 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F2P00734 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F2P00734 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F2P00734 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F2P00734 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F2P00734 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F2P00734 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F2P00734 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F2P00734 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
F2P00734 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F2P00734 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F2P00734 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F2P00734 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F2P00734 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F2P00734 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F2P00734 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F2P00734 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F2P00734 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F2P00734 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms