Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4FO95754 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4FO95754 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms