Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms