Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
POLR1AO95602 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms