Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN7O95471 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms