Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX3O95343 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX3O95343 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX3O95343 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX3O95343 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX3O95343 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX3O95343 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX3O95343 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX3O95343 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX3O95343 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX3O95343 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX3O95343 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX3O95343 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX3O95343 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX3O95343 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX3O95343 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIX3O95343 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIX3O95343 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIX3O95343 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIX3O95343 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIX3O95343 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIX3O95343 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIX3O95343 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIX3O95343 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX3O95343 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX3O95343 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX3O95343 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX3O95343 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX3O95343 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX3O95343 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX3O95343 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX3O95343 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX3O95343 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX3O95343 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX3O95343 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX3O95343 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX3O95343 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX3O95343 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX3O95343 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX3O95343 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX3O95343 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX3O95343 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX3O95343 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX3O95343 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX3O95343 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX3O95343 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX3O95343 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX3O95343 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX3O95343 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX3O95343 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX3O95343 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX3O95343 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX3O95343 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX3O95343 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX3O95343 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX3O95343 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX3O95343 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX3O95343 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX3O95343 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX3O95343 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX3O95343 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX3O95343 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX3O95343 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX3O95343 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX3O95343 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX3O95343 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX3O95343 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX3O95343 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX3O95343 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX3O95343 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX3O95343 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms