Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPBO95292 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPBO95292 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPBO95292 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPBO95292 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPBO95292 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAPBO95292 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAPBO95292 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAPBO95292 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAPBO95292 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAPBO95292 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAPBO95292 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAPBO95292 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAPBO95292 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAPBO95292 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPBO95292 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPBO95292 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPBO95292 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPBO95292 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPBO95292 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPBO95292 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPBO95292 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPBO95292 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPBO95292 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPBO95292 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPBO95292 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPBO95292 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAPBO95292 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPBO95292 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPBO95292 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPBO95292 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPBO95292 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPBO95292 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPBO95292 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPBO95292 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAPBO95292 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAPBO95292 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPBO95292 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPBO95292 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPBO95292 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPBO95292 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPBO95292 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPBO95292 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPBO95292 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPBO95292 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPBO95292 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPBO95292 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPBO95292 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPBO95292 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPBO95292 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPBO95292 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPBO95292 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPBO95292 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPBO95292 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPBO95292 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPBO95292 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPBO95292 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPBO95292 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPBO95292 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPBO95292 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPBO95292 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPBO95292 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPBO95292 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPBO95292 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPBO95292 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPBO95292 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPBO95292 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPBO95292 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPBO95292 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPBO95292 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPBO95292 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPBO95292 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPBO95292 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPBO95292 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAPBO95292 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms