Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNUPNO95149 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNUPNO95149 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNUPNO95149 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNUPNO95149 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNUPNO95149 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNUPNO95149 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNUPNO95149 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNUPNO95149 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNUPNO95149 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNUPNO95149 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNUPNO95149 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNUPNO95149 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNUPNO95149 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNUPNO95149 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNUPNO95149 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNUPNO95149 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNUPNO95149 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNUPNO95149 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNUPNO95149 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNUPNO95149 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNUPNO95149 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNUPNO95149 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNUPNO95149 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNUPNO95149 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNUPNO95149 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNUPNO95149 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms