Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOBTB3O94955 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms