Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM2O94769 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM2O94769 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM2O94769 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM2O94769 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM2O94769 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM2O94769 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM2O94769 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM2O94769 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM2O94769 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM2O94769 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM2O94769 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM2O94769 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM2O94769 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM2O94769 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM2O94769 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM2O94769 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM2O94769 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM2O94769 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM2O94769 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM2O94769 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM2O94769 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM2O94769 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM2O94769 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM2O94769 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM2O94769 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM2O94769 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM2O94769 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM2O94769 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM2O94769 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM2O94769 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM2O94769 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM2O94769 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM2O94769 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM2O94769 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM2O94769 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM2O94769 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM2O94769 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM2O94769 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM2O94769 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM2O94769 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM2O94769 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM2O94769 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM2O94769 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM2O94769 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM2O94769 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM2O94769 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM2O94769 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM2O94769 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM2O94769 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM2O94769 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM2O94769 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM2O94769 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM2O94769 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM2O94769 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM2O94769 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM2O94769 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM2O94769 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM2O94769 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM2O94769 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM2O94769 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM2O94769 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM2O94769 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM2O94769 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ECM2O94769 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ECM2O94769 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ECM2O94769 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM2O94769 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM2O94769 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM2O94769 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM2O94769 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM2O94769 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM2O94769 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM2O94769 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM2O94769 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM2O94769 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM2O94769 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM2O94769 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM2O94769 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM2O94769 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM2O94769 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM2O94769 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM2O94769 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM2O94769 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM2O94769 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM2O94769 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM2O94769 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms