Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN5O75503 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN5O75503 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN5O75503 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN5O75503 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN5O75503 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN5O75503 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN5O75503 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN5O75503 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN5O75503 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN5O75503 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN5O75503 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN5O75503 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN5O75503 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN5O75503 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN5O75503 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN5O75503 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN5O75503 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN5O75503 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN5O75503 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN5O75503 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN5O75503 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN5O75503 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN5O75503 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN5O75503 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN5O75503 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN5O75503 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN5O75503 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN5O75503 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN5O75503 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN5O75503 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN5O75503 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN5O75503 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN5O75503 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN5O75503 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN5O75503 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN5O75503 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN5O75503 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN5O75503 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN5O75503 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN5O75503 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN5O75503 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN5O75503 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN5O75503 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN5O75503 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN5O75503 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN5O75503 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN5O75503 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN5O75503 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN5O75503 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN5O75503 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN5O75503 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN5O75503 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN5O75503 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms