Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms