Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms