Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG13O75143 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG13O75143 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG13O75143 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG13O75143 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG13O75143 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG13O75143 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG13O75143 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG13O75143 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG13O75143 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG13O75143 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG13O75143 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG13O75143 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG13O75143 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATG13O75143 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATG13O75143 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATG13O75143 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG13O75143 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG13O75143 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG13O75143 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG13O75143 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG13O75143 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG13O75143 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG13O75143 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG13O75143 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG13O75143 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG13O75143 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG13O75143 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG13O75143 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG13O75143 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG13O75143 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG13O75143 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG13O75143 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG13O75143 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG13O75143 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG13O75143 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG13O75143 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG13O75143 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG13O75143 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG13O75143 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG13O75143 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG13O75143 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG13O75143 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG13O75143 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG13O75143 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG13O75143 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG13O75143 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG13O75143 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG13O75143 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG13O75143 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG13O75143 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG13O75143 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG13O75143 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG13O75143 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG13O75143 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG13O75143 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG13O75143 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG13O75143 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG13O75143 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG13O75143 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG13O75143 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG13O75143 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG13O75143 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG13O75143 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG13O75143 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG13O75143 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG13O75143 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG13O75143 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG13O75143 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG13O75143 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG13O75143 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG13O75143 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG13O75143 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG13O75143 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms