Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBNO60934 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NBNO60934 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBNO60934 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBNO60934 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBNO60934 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBNO60934 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBNO60934 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBNO60934 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBNO60934 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBNO60934 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBNO60934 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBNO60934 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBNO60934 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBNO60934 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBNO60934 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBNO60934 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBNO60934 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBNO60934 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBNO60934 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBNO60934 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBNO60934 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBNO60934 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBNO60934 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBNO60934 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBNO60934 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBNO60934 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBNO60934 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBNO60934 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBNO60934 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBNO60934 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBNO60934 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBNO60934 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBNO60934 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NBNO60934 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBNO60934 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBNO60934 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NBNO60934 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBNO60934 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBNO60934 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBNO60934 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBNO60934 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NBNO60934 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBNO60934 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBNO60934 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBNO60934 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBNO60934 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBNO60934 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBNO60934 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBNO60934 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBNO60934 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBNO60934 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBNO60934 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBNO60934 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBNO60934 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBNO60934 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBNO60934 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBNO60934 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBNO60934 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBNO60934 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NBNO60934 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBNO60934 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBNO60934 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NBNO60934 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBNO60934 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBNO60934 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBNO60934 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBNO60934 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBNO60934 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBNO60934 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBNO60934 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms