Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUTAO60888 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUTAO60888 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUTAO60888 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUTAO60888 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUTAO60888 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUTAO60888 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUTAO60888 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUTAO60888 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUTAO60888 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUTAO60888 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUTAO60888 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUTAO60888 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUTAO60888 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUTAO60888 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUTAO60888 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUTAO60888 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUTAO60888 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUTAO60888 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUTAO60888 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUTAO60888 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUTAO60888 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUTAO60888 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUTAO60888 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUTAO60888 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUTAO60888 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUTAO60888 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUTAO60888 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUTAO60888 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUTAO60888 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUTAO60888 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUTAO60888 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUTAO60888 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUTAO60888 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUTAO60888 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUTAO60888 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUTAO60888 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CUTAO60888 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CUTAO60888 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CUTAO60888 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUTAO60888 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CUTAO60888 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUTAO60888 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUTAO60888 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUTAO60888 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUTAO60888 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUTAO60888 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUTAO60888 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUTAO60888 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUTAO60888 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CUTAO60888 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUTAO60888 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUTAO60888 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUTAO60888 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUTAO60888 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUTAO60888 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms