Protein–RNA interactions for Protein: O60637

TSPAN3, Tetraspanin-3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3O60637 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN3O60637 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms