Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms