Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms