Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSNA1O43805 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSNA1O43805 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms