Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms