Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51CO43502 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms