Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID2O43424 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID2O43424 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID2O43424 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID2O43424 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID2O43424 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID2O43424 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRID2O43424 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRID2O43424 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRID2O43424 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRID2O43424 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRID2O43424 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRID2O43424 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRID2O43424 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID2O43424 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID2O43424 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID2O43424 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID2O43424 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID2O43424 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID2O43424 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID2O43424 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID2O43424 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID2O43424 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID2O43424 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID2O43424 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID2O43424 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID2O43424 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID2O43424 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID2O43424 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID2O43424 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID2O43424 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID2O43424 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID2O43424 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID2O43424 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID2O43424 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID2O43424 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID2O43424 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID2O43424 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms