Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms