Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRTM2O43300 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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