Protein–RNA interactions for Protein: O43236

SEPT4, Septin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT4O43236 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEPT4O43236 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms