Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRXO43186 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRXO43186 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRXO43186 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRXO43186 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRXO43186 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRXO43186 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRXO43186 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRXO43186 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRXO43186 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRXO43186 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRXO43186 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRXO43186 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRXO43186 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRXO43186 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRXO43186 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRXO43186 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRXO43186 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRXO43186 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRXO43186 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRXO43186 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRXO43186 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRXO43186 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRXO43186 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRXO43186 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRXO43186 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRXO43186 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRXO43186 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRXO43186 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRXO43186 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRXO43186 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRXO43186 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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