Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms