Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM6AO15550 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KDM6AO15550 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms