Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PFDN6O15212 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN6O15212 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN6O15212 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN6O15212 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN6O15212 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN6O15212 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN6O15212 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN6O15212 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN6O15212 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN6O15212 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN6O15212 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms