Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM4SF5O14894 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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