Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKBIEO00221 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms