Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms