Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
J3KT08 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
J3KT08 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
J3KT08 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
J3KT08 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
J3KT08 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms