Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB9F8W1W9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms