Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PBE3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PBE3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PBE3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PBE3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PBE3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PBE3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PBE3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PBE3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PBE3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PBE3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PBE3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PBE3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PBE3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PBE3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PBE3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PBE3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PBE3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PBE3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PBE3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PBE3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PBE3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PBE3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PBE3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PBE3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PBE3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PBE3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PBE3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PBE3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PBE3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PBE3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PBE3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PBE3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PBE3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PBE3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PBE3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PBE3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PBE3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PBE3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PBE3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PBE3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PBE3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PBE3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PBE3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PBE3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PBE3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PBE3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PBE3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PBE3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PBE3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PBE3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PBE3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PBE3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PBE3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PBE3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PBE3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PBE3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PBE3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PBE3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PBE3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PBE3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PBE3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PBE3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PBE3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PBE3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PBE3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PBE3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PBE3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PBE3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PBE3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PBE3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms