Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms