Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms