Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCO5BA8MYB1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO5BA8MYB1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms